اگر فوق لیسانسش هم بورسیه است باید بره سربازی ، ضمن اینکه استعفای شما پذیرفته نمی شود 

با سلام و ید شرایط قرارداد اولیه ایشان

و شرایط خواندن ارشد در کدام مرجع و نظام وظیفه بررسی گردد

اگر معافیت تحصیلی ارشد به صورت رسمی از نظام وظیفه برایتان ثبت و فعال شده باشد و بین استعفا تا شروع ارشد فاصله ای که موجب غیبت شود ایجاد نشود معمولا اجازه ادامه تحصیل از شما گرفته نمی شود و مستقیم به سربازی اعزام نمی شوید
اما استعفا قبل از پایان تعهد خدمت معمولا برای شما مسئولیت مالی و اداری بابت نقض تعهد ایجاد می کند و باید با آموزش و پرورش تسویه شود
همچنین معافیت تحصیلی هر مقطع شرایط و محدودیت های خودش را دارد و اگر قبلا برای همان مقطع استفاده شده باشد ممکن است دوباره صادر نشود

سلام و عرض ادب

در صورتی که معلم قبل از پایان ۸ سال تعهد خدمت استعفا دهد، معافیت تحصیلی ارشد او به دلیل تعهد خدمت قبلی لغو می‌شود و معمولاً باید ابتدا تکلیف سربازی خود را مشخص کند؛ یعنی بدون تکمیل سنوات تعهد، اجازه ادامه تحصیل تحت معافیت تحصیلی به او داده نمی‌شود

از طریق ارگان مربوطه پیگیری کنید

سلام، طبق قوانین فعلی اگر استعفا پذیرفته شود و معافیت تحصیلی معتبر دانشگاهی داشته باشید، می‌توانید به تحصیل ادامه دهید، اما در غیر این صورت بلافاصله مشمول خدمت سربازی خواهید شد. بنابراین ادامه تحصیل شما به تداوم اعتبار معافیت تحصیلی صادر شده از سوی نظام وظیفه بستگی دارد و لزوماً با استعفا از آموزش و پرورش ابطال نمی‌شود.